Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SarnpQ9D1J3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms