Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms