Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms