Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ube2cQ9D1C1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ube2cQ9D1C1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms