Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hddc3Q9D114 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc3Q9D114 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms