Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Zbed3Q9D0L1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zbed3Q9D0L1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms