Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Elp3Q9CZX0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Elp3Q9CZX0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms