Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf146Q9CZW6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Rnf146Q9CZW6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf146Q9CZW6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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