Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shmt2Q9CZN7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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