Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc77Q9CZH8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc77Q9CZH8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms