Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl55Q9CZ83 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl55Q9CZ83 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms