Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sgo1Q9CXH7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Sgo1Q9CXH7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sgo1Q9CXH7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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