Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddx28Q9CWT6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ddx28Q9CWT6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ddx28Q9CWT6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ddx28Q9CWT6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ddx28Q9CWT6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ddx28Q9CWT6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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