Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms