Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms