Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdm1Q9CQK3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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