Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpb2Q9CQI7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpb2Q9CQI7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms