Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
StambpQ9CQ26 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms