Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2a1Q99PM3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2a1Q99PM3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms