Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cep41Q99NF3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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