Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b1Q99NB9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms