Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ms4a6cQ99N08 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ms4a6cQ99N08 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ms4a6cQ99N08 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ms4a6cQ99N08 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ms4a6cQ99N08 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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