Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms