Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc1Q99MR8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms