Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms