Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms