Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Abcf2Q99LE6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf2Q99LE6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms