Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TriobpQ99KW3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TriobpQ99KW3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms