Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms