Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hps4Q99KG7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps4Q99KG7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms