Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxp3Q99JB6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms