Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ddb2Q99J79 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ddb2Q99J79 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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