Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan1Q99J59 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan1Q99J59 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms