Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Smim11aQ99J19 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Smim11aQ99J19 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Smim11aQ99J19 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim11aQ99J19 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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