Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ctu1Q99J10 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms