Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc8b1Q925Q3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms