Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx15Q91WE1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx15Q91WE1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms