Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac11Q91WA3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac11Q91WA3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms