Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csde1Q91W50 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms