Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp3Q91W36 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms