Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms