Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf4Q8VE97 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf4Q8VE97 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf4Q8VE97 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Srsf4Q8VE97 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Srsf4Q8VE97 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Srsf4Q8VE97 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Srsf4Q8VE97 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Srsf4Q8VE97 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Srsf4Q8VE97 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms