Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam20bQ8VCS3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Fam20bQ8VCS3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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