Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmx1Q8VBT0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms