Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Defb12Q8K4N3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms