Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mkl1Q8K4J6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms