Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf39Q8K2Z2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpf39Q8K2Z2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms