Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl47Q8K2Y7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl47Q8K2Y7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms