Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Trappc12Q8K2L8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms