Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scara5Q8K299 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms